El Liceo Municipal Atenea fue creado como la primera Escuela Primaria de Cunco el 3 de Julio de 1908, bajo la dirección de la Preceptora Señora Amalia Pinto Suárez, comienza a funcionar la Escuela Nº 40 de niñas y 41 de hombres, posteriormente se fusionan dando origen a la Escuela coeducacional Nº 168. En 1978 se crea el Liceo C-32 en atención al oficio circular Nº 6 de la Dirección de Personal del Ministerio de Educación, Nº 7, inciso2º.en el que decretaba que la ex escuela Nº 168 de Cunco pasaba a ser clasificada como liceo, llamándose desde esta fecha Liceo C-32, siendo en 1981 municipalizado, por Resolución del Ministerio de Educación en 1995 paso a llamarse Liceo Atenea.
Se encuentra ubicado en Avenida Santa María número 519 de la comuna de Cunco. El primer director interino, fue el profesor Arturo Toro Herrera.
El liceo inicia sus funciones con los niveles de, Pre básica y básica y Educación Media en modalidad vespertina. En el año 1980 comienza a operar el primer año medio en jornada diurna lo que fue progresivamente aumentando hasta tener todos los niveles de Enseñanza Media.